După măsurarea lungimii canalului radicular se începe realizarea tratamentului mecanic de canal ce constă în lărgirea canalului cu ajutorul acelor de canal. Tratamentul mecanic în extirpare trebuie să se facă dintr-o dată pe tot traiectul canalului, să se realizeze condiții perfecte de asepsie si sa nu se trepaneaze apexul. Tratamentul mecanic începe cu acele cele mai subțiri când canalele sunt strâmte. Dupa terminarea tratamentului mecanic se face toaleta canalelor cu ajutorul meșelor. După tratamentul mecanic avem de ales între două posibilități de continuare a tratamentului și anume: obturația de canal în aceeași ședință cu extirparea sau efectuarea unui tratament medicamentos și amânarea obturării canalului pentru ședința următoare. Tratamentul medicamentos se face cu soluție Walkoff sau alt antiseptic sau pastă cu antibiotic iar închiderea se face cu un material de obturație provizoriu ce se aplică etanș.   

În funcție de dintele afectat acesta poate prezenta între 1-4 canale. De exemplu premolarul 1 superior prezinta 2 canale. Molarul 1 superior poate prezenta 3 (60% dintre cazuri) sau 4 canale (40% dintre cazuri). Molarul 2 superior poate prezenta 3 (57%) sau 4 canale (40%).