In cadrul sectiilor de reparatii functioneaza doua ateliere de baza:

• Atelierul mecanic, care asigura lucrarile de intretinere si reparatii la agregatele si componentele mecanice, pneumatice si hidraulice din dotarea materialului rulant si naval;
• Atelierul electric, care asigura lucrarile de intretinere si reparatii la masinile electrice, echipamentele electrice, electronice si automatizate din dotarea materialului rulant si naval.

Personalul de reparatii din cadrul sectiei navale este organizat sa isi desfasoare activitatea atat in atelierele societatii, cat si cu echipe mobile la bordul navelor.TEHNOTRANS FEROVIAR S.R.L. are incheiate parteneriate cu alte societati din domeniul naval, fapt ce permite abordarea intregii game de reparatii, functie de complexitatea lucrarilor.