Ca functionalitate principala, Hipocrate integreaza si interconecteaza toate activitatile medicale de spital, laborator, imagistica, farmacie, programe nationale de sanatate (ex. Diabet, Dializa, TBC) si ambulatoriu de specialitate cu activitatile complexe de management si raportare in domeniul medical. Prin intermediul lui se urmareste pacientul incepand de la prezentarea sa la sectia de garda sau biroul de internari, este condus printre examinari si consulturi interdisciplinare spre internarea pe o sectie, la un anumit medic si intr-un anume pat. De asemenea, urmareste tratamentul medicamentos administrat, investigatiile paraclinice efectuate (laborator, explorari functionale, radiologie, etc.), cunoaste regimurile de masa administrate si se ocupa de externarea pacientului adunand toate datele cu profil medical prin intermediul epicrizei, in Fisa de externare, in Biletul de externare sau in Scrisoarea medicala catre medicul de familie. In decursul internarii – automat – sistemul actualizeaza diversele consumuri per pacient, cum sunt medicamentele si materialele sanitare, cheltuieli pentru hrana si spitalizare, analize de laborator si radiologie, evidentiate in Decontul pacientului. Statisticile legate de zilele de spitalizare, duratele medii de spitalizare, rulaj paturi si utilizare paturi, sunt actualizate, de asemenea, automat.